Romain DAVID

Saturday 11 May 2013
by  Romain DAVID
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Romain DAVID

PhD? Student CNRS?

Institut Méditerranéen de Biodiversité et d’Ecologie Marine et Continentale (IMBE?)
Université Aix-Marseille, UMR? CNRS 7263 / IRD? 237
Station Marine d’Endoume,
Chemin de la Batterie des Lions
13007 MARSEILLE
Tel : 04 91 04 16 51
port : 06 14 74 30 54
romain.david at imbe.fr

Je suis doctorant au CNRS en écologie marine intégré dans l’équipe transversale dédiée au transfert des connaissances pour la gestion de la biodiversité de l’IMBE (UMR 6372 Institut Méditerranéen de Biodiversité et d’Ecologie marine et continentale) ; je possède une double compétence et une expérience de 10 ans en génie écologique terrestre / marin et programmation, gestion de bases de données et animation de réseaux.
Je m’intéresse particulièrement aux peuplements benthiques marins.

Bio

Jusqu’en 2015

Je suis en thèse à l’IMBE, et je travaille sur la mise en place d’un réseau d’observateurs de l’habitat? coralligène. Ce travail me permet d’améliorer mes connaissances en taxonomie, et de mettre à l’épreuve mon expérience dans le domaine de la conception de systèmes d’information innovants. Il a pour but de mieux estimer l’état relatif de ce type d’habitat, consiste à développer de nouvelles méthodes d’expertises écologiques, nécessite la formation et l’animation d’un réseau d’experts et l’utilisation à bon escient de nouvelles technologies dans le domaine du libre.

CENTRES D’INTÉRÊTS

Je suis particulièrement attiré par la thématique de la biodiversité marine benthique, et des liens de cette biodiversité avec la qualité du milieu, des interactions anthropiques et du rôle de bio-marqueurs que peuvent avoir certaines espèces.

MES ATOUTS COMPLÉMENTAIRES

Je possède des qualifications de plongée professionnelle (Classe 2 B et Chef de plongée Scientifique du CNRS, certifications NITROX, CRR) et différents permis bateau
Je met à profit mes compétences professionnelles acquises antérieurement :
une bonne maîtrise de nombreux langages informatiques
et une solide expérience en gestion de projets

Specialités

Systèmes d’information

Systèmes d’observation

  • protocoles,
  • dispositifs et méthodes de collecte d’information sur la biodiversité,
  • taxonomie des invertébrés,
  • mise en place de réseaux de surveillance à différentes échelles géographiques,

Systèmes prospectifs

  • analyse de données biologiques,
  • statistiques avancées,
  • Géomatique
Jusqu’en 2012 :

Ma mission a consisté à développer et animer des communautés d’acteurs ayant pour objectif de mettre en place de véritables réseaux de suivis des milieux sur la façade méditerranéenne.
Ce travail m’a permis d’allier les compétences acquises en traitement de données et mon expertise en systèmes d’information avec du travail de terrain

Dans ce cadre, j’ai eu l’occasion de commencer à travailler comme je l’espérais sur les invertébrés marins benthiques et la flore marine.

la science se nourrit de ses doutes,
l’expertise se nourrit de ses certitude

Formation

Cursus scientifique

2012 Workshop Biodivmex « biodiversité du bassin méditerranéen » – Université de Malte
2010 UE « Structure et fonctionnement des Écosystèmes coralliens » (mention Très Bien) – EPHE de Perpignan
2010 Stage « Analyse Exploratoire Multidimensionnelles en Environnement » – observatoire océanographique de Villefranche sur Mer
2010 Master 2 Recherche en Océanologie côtière – Université de Paris 6 Pierre et Marie Curie, Stations de Roscoff , Banyuls
2005 Master 2 Pro (mention Bien) en Génie écologique – Université de Poitiers

Aptitudes techniques

2012 Expérimentation Animale N1 « connaissance et protection de l’animal de laboratoire – méthodologie expérimentale » (arrêté du 19/04/1998)
2007 DU Ethno botanique appliquée suivi – Université de pharmacie de Lille 2
2006 DU (mention Bien) "Photographie Nature" – IFFCAM Université de Poitiers
2004 DU (mention Bien) “Accessibilité du web” – Université de Pierre et Marie Curie, Paris
2000 D.U.T. « Informatique et génie des logiciels » – Université de Bordeaux
A distance en 2011 : 12 ECTS validés du Master 2 « Gestion des Entreprises et Administration » – IAE Université de Poitiers

Aptitudes à la mer

  • Chef de plongée Scientifique du CNRS - CAH Classe 2B (travail scientifique et technique jusqu’à 50 mètres), INPP n°014/11-2B
  • Certificat d’aptitude à l’utilisation du Nitrox (confirmé), Photographie sous marine scientifique et reportage, 50 plongées professionnelles
  • CMAS *** (N3 FFESSM n°407459 et Rescue Diver PADI n° 1212EK9114 ) licence n°A-03-046671 -150 plongées loisir
  • Permis côtier, permis eaux intérieures, Certificat de Radiotéléphonie Restreint, Premiers Secours en Équipe 1

En projet : CBS,Permis hauturier, Premiers Secours en Équipe 1

Plus de détail dur ma formation en océanologie (depuis 2010)

Mon stage de master Océanologie côtières’est déroulé à l’IFREMER? de Brest avec Dominique PELLETIER (Département des Techniques Halieutiques) et je travaillais sur les indicateurs d’efficacité? de gestion des Aires Marines Protégées (AMP) et les scripts (R) associés (programme PAMPA).

J’ai suivi, avant mon stage à l’Ifremer, les enseignements du Master d’Océanographie et Environnement Marin spécialité "océanologie côtière" à l’université Paris 6 (UPMC : Université Pierre et Marie Curie).

voici les enseignements spécifiques du parcours "côtier" :

  • description et suivi d’une population, de ses paramètres démographiques et phylogéographie? des peuplements (module ECOPOP),
  • étude de la reproduction, des chaînes trophiques, effet des conditions trophiques sur la chaine alimentaire (partie du module FLUMECO)
  • interactions entre l’environnement côtier (flux de carbone, nutriments, biomasses et modélisation dans FLUMECO) et impact de la production primaire (module FELICO) sur la faune (invertébrés et poissons) rattachée au benthos (marquages isotopiques, étude de méiofaune, macrofaune)
  • en option, "adaptation / acclimatation des organismes". Au court de ce module optionnel, nous avons perfectionné nos connaissances et notre pratique des techniques moléculaires (PCR, (rt)QPCR, Western blot et ISH) La majorité des enseignements de ce master (cours et TP?) en anglais

Expérience

Ingénieur d’étude Centre National de la Recherche Scientifique (C.N.R.S.), et Agence des Aires Marines Protégées (A.A.M.P.)

Station Marine d’Endoume (S.M.E.) / équipe DIMAR? (UMR 6540) du Centre d’Océanologie de Marseille (COM), puis au 1er Janvier 2012 équipe 5 et équipe 7 (transversale) de l’Institut Méditerranéen de Biologie et d’Écologie Marine et Continentale (I.M.B.E.)
composante transversale : aide à la gestion de l’environnement et transfert de la connaissance scientifique

(2011 – 2012) Chargé de mission « SINP Mer » Pour la façade Méditerranée
Développement de réseaux thématiques de suivi et d’observation, et conceptiond’une interface d’analyse écosystémique
Normalisation des procédures et développement de référentiels de préconisations
Mise en place de procédures qualité et de validation des données, identification des lacunes, formation des opérateurs
Recensement, saisie, administration et validation des acteurs et dispositifs de collecte du réseau sur les interfaces du SINP mer
Identification des descripteurs/indicateurs liés au SINP utiles aux démarches clientes telles que la DCSMM, le Tableau de bord des mers françaises, le tableau de bord des aires marines protégées, le rapportage ORB, ZNIEFF? et Natura2000

Exemples de chantiers :
http://www.rammm.fr,
http://oiseaux-marins.fr,
http://biodivmex.imbe.fr,
http://www.coralligene.fr,
http://www.reseau-herbiers.fr.

Chef de projet Observatoire Régional de l’Environnement (O.R?.E.) Poitou-Charentes

(2005 - 2010) Chargé de mission « Patrimoine Naturel »
Création et animation du Réseau Partenarial des Acteurs du Patrimoine Naturel (40 structures, premier O.R.B. en France)
Soutiens techniques aux acteurs du Patrimoine Naturel (RPAPN, mise en place du SINP en Poitou-Charentes)
Saisie, administration et validation des protocoles du réseau sur les interfaces du SINP
Organisation des rencontres de Chizé sur la diffusion de la connaissance sur le Patrimoine Naturel
Pilote d’un programme d’action de 200 000 euros (masse salariale exclusivement), gestion des dossiers de demande de subventions (Conseils Généraux, Conseil Régional, Etat, FEDER? et autres fonds européens), mise en œuvre et rédaction des bilans

(2000 - 2005) Responsable Internet et Bases de données
Gestion et développement de produits informatiques liés aux données environnementales
Responsable des sites Internet et de la structuration de la partie « environnement » du Système d’Information Régional (SIR) et RBDD
Soutiens techniques aux acteurs de l’environnement (analyse et conception des systèmes de gestion des données), projets de valorisation de l’information environnementale avec les partenaires (intranets, extranets)

Exemples de chantiers :

Stages

2010 Laboratoire des Techniques Halieutiques à l’IFREMER de Brest 5 mois
Axe « WP2 » de PAMPA : exploitations de données sur les inventaires d’habitats et d’espèces et scripts de calculs d’indicateurs dans le cadre de la réalisation d’un tableau de bord de l’efficacité de gestion des Aires Marines Protégées.
Compétences acquises : Programmation sur R de routines statistiques uni variées et multivariées, interfaçage avec TCL/Tk
Résultats du stage : Interface d’analyse et application sur un jeu de données d’évolution de recouvrements coralliens de la Réunion.

2006 “Department of Food and Nutritional Sciences” University of Reading, UK 1 mois
Compétences acquises : amélioration de l’anglais, initiation aux techniques moléculaires
Résultat du stage : Réaliser une maquette de système d’information

2005 Conservatoire Régional d’Espaces Naturels 6 mois
Formation continue pour le Master en génie écologique, Université de Poitiers,
Compétences acquises : gestion de l’information sur le Patrimoine Naturel en Poitou-Charentes,
Résultat du stage : mise en place du système d’information et des bases de données du CREN

2000 Observatoire de l’environnement développement "Internet et base de données" 3 mois
DUT Informatique de l’université de Bordeaux 1
Objectifs du stage : développer un système d’information pour l’ORE
Compétences acquises : Bases de données environnementales (Acess, MySQL) programmation PHP, ASP

1997 Laboratoire d’écologie « écologie intertidale » Université de SWANSEA, Wales 4 mois
stage volontaire en ERASMUS à l’université de Swansea, Pays de Galles,
Objectifs du stage : initiation à la biologie marine et découverte du milieu de la recherche
Compétences acquises : amélioration de l’anglais, premières approches du travail naturaliste de terrain, « quadrats », « transects » et comparaisons statistiques entre zones faiblement et fortement « anthropisées » sur l’estran

1996 Laboratoire de biologie des poissons (U. Bdx 1) Gametogenesis - Histology 1 mois
Stage estival volontaire non rémunéré - Université de Bordeaux
Objectifs du stage : découvrir des techniques de laboratoire
Expériences acquises : Microtome / histologie / Caryotype / photométrie microscope / sexage d’esturgeons

Compétences

Compétences principales (utilisées régulièrement)

Niveau de pratique Intensif Régulier
Écologie fondamentale Expertise des peuplements du coralligène Suivi des peuplements benthiques (cohortes, abondance/dominance)
mesure des processus à l’échelle d’un organisme ou d’un système,
Plongée scientifique Photographie subaquatique, prospections subaquatiques, prélèvements, mesures in situ, transept et quadrats (150 plongées loisirs, 50 professionnelles)
Taxonomie Détermination de phanérogames, macro algues, invertébrés marins fixés,
Management Gestion et suivi de projet, Rédaction de cahiers des charges, de projets, de bilans et de rapports, recherche de subventions, encadrement et gestion d’équipe, préparation et conduite de réunion, formation,
Communication Conception d’outils de diffusion des connaissances, présentations techniques Partage des connaissances, vulgarisation scientifique, conception de supports de communication (plaquettes, livrets...),
Informatique Internet Développement WEB, CMS spip ASP, PhP, XML, DreamWeaver, Normes d’accessibilités,
Bases de données mySQL, Access,
Traitement de données R Statistiques inférentielles, outils multivariés
Langages C, C++, Java, TCL-TK pour R
Réseaux Linux, Windows (3.1 et +), Apache, Ethernet, Administration serveur web, mail, news Proxy
SIG? MapInfo, ArcGIS, QGIS, Grass, Openlayer
Photographie photographie d’espèces, quadrats Macro, retouche et composition d’images, Photoshop, GIMP
Langues Anglais (TOEIC : 645/990 puis cours de master en anglais)
Bureautique Excel, Word, Open-Office, PowerPoint, Endnote

Conférences

  • 2013 8 février : « la capitalisation et de la gestion des données en écologie : quelles responsabilités, quels enjeux » Conseil scientifique de l’INEE?, CNRS.
  • 2012 29 octobre : « L’exemple de la capitalisation et de la gestion des données en écologie » Réunion de façade acteurs mammifères marins - GIS3M
  • 2012 23 octobre : « L’exemple de la capitalisation et de la gestion des données en écologie » projet OGIIS (Outils de Gestion Intégrée de l’Information), pour la mise en place d’une plateforme de gestion de l’information à caractère scientifique au niveau du RHOM (Réseau des Observatoire Hommes-Milieux).
  • 2012 21 septembre : « L’exemple de la capitalisation des données en écologie » Observatoire Hommes-Milieux « Littoral Méditerranéen » - Séminaire inaugural
  • 2012 12 avril : présentation SINP Mer à Sète (IFREMER + IRD)
  • 2012 9 mars : présentation SINP Mer à Corte (Université de Corse)
  • 2012 6 mars : présentation SINP Mer à Stareso (Université de Liège, Corse)
  • 2012 8 février : présentation SINP Mer à Banyuls (Laboratoire Arago)
  • 2012 9 février : présentation SINP Mer à Perpignan (CEFREM)
  • 2012 26 janvier : Réunion technique Bases de données avec présentation SINP Mer à Nantes (IFREMER)
  • 2011 30 novembre : présentation SINP Mer assemblée générale du GIS? Posidonie (Station Marine d’Endoume)
  • 2011 Table ronde (1 heure 30), Inauguration du CESAB (Fondation pour la Recherche sur la Biodiversité), Enjeux de la recherche sur la biodiversité en PACA?
  • 2011 Table ronde (2 heures), URVN PACA, Le SINP : bilan des connaissances et enjeux de la structuration des systèmes d’information sur la biodiversité
  • 2008, Conférence (3 heures), Université de droit et sciences économiques de Poitiers (45 participants représentants officiels Chinois) Enjeux des systèmes d’information sur l’eau et la biodiversité, impacts prévisibles des changements globaux en Poitou-Charentes.
  • 2005 Conférence (3 heures), Ville de Poitiers : Création d’un système d’information sur l’environnement,

Encadrement

Lors de mes précédentes expériences professionnelles, j’ai eu l’occasion d’accueillir et d’encadrer quelques stagiaires. Pour la plupart, ils ont ensuite vécu leur première expérience dans la structure dans laquelle ils ont fait leur stage :

Encadrement de stages longs et postes occupés ensuite

Année Prénom NOM Thème du stage Suite
2009 Julia JORDA Système d’Information en écologie école de journalisme
2008 Marianne MAIRE VIGUEUR « conception d’un Quizz sur le patrimoine Naturel » Techncienne HSE, GIE SANTE TRAVAIL
2007 Benoit GUENON « répertoire des études » poursuite de formation
2006 Jalila DRISSI-AMRAOUI refonte et création des différents sites web gérés par l’ORE en respectant les normes d’Accessibilité CDI à l’ORE
2005 Raphaël MARTIN développement d’un répertoire des acteurs – actuellement responsable réseau et bases de données CDI à l’ORE
2004 Jennifer DABAT ROUL Tableau de bord de l’environnement – partie biodiversité CDI à l’ORE

Référents

Recherche - Dr Jean-Pierre FERAL (Directeur de recherche)
Station Marine d’Endoume
Chemin de la batterie des lions 13007 Marseille
+33 (0) 491041663
jean-pierre.feral@imbe.fr

  • Pr Denise BELLAN-SANTINI (Directeur de recherche)
    Station Marine d’Endoume
    Chemin de la batterie des lions 13007 Marseille
    +33 (0) 491041633
    denise.bellan@imbe.fr
  • Dr Frédérique VIARD (Directeur de recherche)
    Station Biologique de Roscoff
    Place Georges Teissier BP74
    29682 Roscoff Cedex
    +33 (0) 298 292 500
    viard@sb-roscoff.fr
  • Dr Eric THIEBAUT (maître de conférence à Paris 6)
    Station Biologique de Roscoff
    Place Georges Teissier BP74 29682 Roscoff Cedex
    +33 (0) 298 292 531
    thiebaut@sb-roscoff.fr
Animation de réseau - Alain PIBOT (directeur d’antenne)
Antenne Méditerranée
Agence des Aires Marines Protégées
26, rue de la république 13001 MARSEILLE
+33 (0) 4—
alain.pibot@aires-marines.fr

  • Benjamin GUICHARD (responsable national SINP)
    Agence des Aires Marines Protégées
    16, quai de la douane
    BP 42932, 29229 BREST Cedex 2
    +33 (0) 298338767
    benjamin.guichard@aires-marines.fr
  • Antoine HUGUET (responsable de département)
    Département DYNECO / VIGIES : Valorisation de l’Information pour la Gestion Intégrée et la Surveillance IFREMER NANTES Rue de l’île d’Yeu - BP 21105
    44311 - NANTES CEDEX 3
    +33 (0) 240374186
    antoine.huguet@ifremer.fr
  • Dr Laurent DEBAS (directeur)
    Planète Mer
    24, rue Falque 13006 Marseille
    +33 (0) 614357261
    laurent.debas@planete-mer.fr
Systèmes d’informations - Franck TROUSLOT (directeur)
ORE : Observatoire Régional de l’Environnement
Téléport 4 Antarès B.P. 50163
86962 Futuroscope Chasseneuil Cedex
+33 (0) 549 496 103
trouslot@observatoire-enbironnement.org

  • Patricia BUSSEROLE (directeur)
    CREN : Conservatoire Régional des Espaces
    Naturels Poitou-Charentes
    44 Boulevard Pont-Achard 86000 POITIERS
    +33 (0) 549 504 259
    busseroles@cren-poitou-charentes.org
  • Dr Dominique PELLETIER (chargée de recherche)
    Laboratoire des Techniques Halieutiques
    IFREMER BREST
    +33 (0) 298 224 684
    Dominique.Pelletier@ifremer.fr
  • Dr David VAUZOUR (chargé de recherche)
    Department of Food and Nutritional Sciences,
    The University of Reading, UK
    +44 (0) 118 378 6652
    d.vauzour@reading.ac.uk

Bientôt une onglet publication

C’est un des grands objectifs de ma thèse : apprendre à produire des publications scientifiques : bientôt !



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